作物遗传育种二级学科硕士点隶属于作物学一级学科， 1992年与外校联合培养硕士研究生，1997被国家批准为硕士学位授权学科， “十五”期间被军队总后勤部评为重点学科，2006年被确认为吉林省高等学校省级重点学科。
　　经多年建设，本学科已形成了一批由30余名教授、副教授青年博士为主体的结构合理高水平的学术梯队。学科主要研究方向包括：作物种质资源发掘及利用，分子标记及其基因定位，作物育种遗传改良。
　　本学科 “十五”以来共承担国家自然科学基金、教育部、总后军需部、吉林省科技厅等科研课题 30 余项，获省级科技进步一等奖 1 项，省级科技进步二等奖 2 项 , 军队科技进步二等奖 2 项，国家级教学成果奖 1 项，吉林省登记科技成果 6 项，国家登记科技成果 2 项 , 发明专利 1 项。主编和参编著作 6 部，在省级以上学术杂志发表论文 200 余篇，其中被 SCI 收录 30 余篇，为该学科的建设发展做出了贡献。
　　作物遗传育种二级学科的优势是教师队伍的年轻化，发展的空间大；以突出生命科学、生物信息学和生物技术等新兴学科与遗传育种的交叉与融合为研究特色，坚持以培养社会需要的复合型人才为目标。现拥有总面积为 1000 余平方米的 5 个专业实验室，总值 700 余万元的大型仪器设备，具备了使该学科持续发展的科研实力和科研环境。

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